untuk mengumpulkan data
database untuk menyimpan dan menyebarluaskan data tersebut. banyak jurnal penelitian dan informasi genetik. Dengan adanya teknologi pendapatan data semakin cepat. terdapat penyimpanan data sebelum dianalisis dan dibandingkan data orang lain. Database adalah data yg diorganisasi. Disimpan dalam 2 bentuk: fields of categories dan record. Field= kolom, record= row
Database biologi dapat dibedakan menjadi: data primer (langsung yg didapatkan, cth: sekuen) dan data sekunder (dari bank). Dari data primer dimasukkan menjadi data sekunder. ada adtabase yang terfokus pada suatu hal tertentu.
format data: harus diseragamkan> berlaku universal, sehingga diperlukan suatu format yang standar.
FASTA format: dapat diterima oleh semua database. dalam hal DNA dan juga protein.
one header line, starts with > with a [return] at end (enter), lalu diasukkan sekuennya.
Multi-sekuen FASTA file: dapat di simpan dalam wordpad atau Ms.word.
Database publik: untuk analisis penelitian. GenBank adalah database. Isinya berupa sekuen DNA dan protein di literatur penelitian atau koleksi di publicly funded research. Accession Number: yang dimasukkan saat pencarian data, lebih mudah dan langsung.
Latihan untuk topik database:
Latihan untuk topik database:
- Salah satu protein yang dibutuhkan dalam metabolisme adalah Hexokinase. Apa kerja dari protein ini dalam metabolisme? Tuliskan dengan rinci!
- Dapatkan semua sekuens protein Hexokinase dari yeast.! (simpan dalam format genbank dan Fasta di notepad)
- Dapatkan semua sekuens gen penyandi hexokinase dari yeast! (simpan dalam format genbank dan Fasta di notepad)
- Carilah sekuens gen penyandi hexokinase dari organisme lain, minimal 2!
Tidak ada komentar:
Posting Komentar